Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H3

ATP23, Mitochondrial inner membrane protease ATP23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP23Q9Y6H3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP23Q9Y6H3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP23Q9Y6H3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP23Q9Y6H3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP23Q9Y6H3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP23Q9Y6H3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP23Q9Y6H3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP23Q9Y6H3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP23Q9Y6H3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP23Q9Y6H3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP23Q9Y6H3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP23Q9Y6H3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP23Q9Y6H3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP23Q9Y6H3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP23Q9Y6H3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP23Q9Y6H3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms