Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCDHB13Q9Y5F0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDHB13Q9Y5F0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDHB13Q9Y5F0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDHB13Q9Y5F0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDHB13Q9Y5F0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDHB13Q9Y5F0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDHB13Q9Y5F0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDHB13Q9Y5F0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDHB13Q9Y5F0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCDHB13Q9Y5F0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCDHB13Q9Y5F0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCDHB13Q9Y5F0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PCDHB13Q9Y5F0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PCDHB13Q9Y5F0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCDHB13Q9Y5F0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDHB13Q9Y5F0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB13Q9Y5F0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCDHB13Q9Y5F0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCDHB13Q9Y5F0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDHB13Q9Y5F0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDHB13Q9Y5F0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
PCDHB13Q9Y5F0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCDHB13Q9Y5F0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHB13Q9Y5F0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHB13Q9Y5F0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHB13Q9Y5F0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHB13Q9Y5F0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHB13Q9Y5F0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHB13Q9Y5F0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHB13Q9Y5F0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHB13Q9Y5F0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDHB13Q9Y5F0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB13Q9Y5F0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PCDHB13Q9Y5F0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms