Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D0

FAM96B, Mitotic spindle-associated MMXD complex subunit MIP18, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM96BQ9Y3D0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM96BQ9Y3D0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM96BQ9Y3D0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM96BQ9Y3D0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM96BQ9Y3D0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM96BQ9Y3D0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM96BQ9Y3D0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM96BQ9Y3D0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM96BQ9Y3D0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM96BQ9Y3D0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM96BQ9Y3D0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM96BQ9Y3D0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM96BQ9Y3D0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM96BQ9Y3D0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM96BQ9Y3D0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM96BQ9Y3D0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM96BQ9Y3D0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM96BQ9Y3D0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM96BQ9Y3D0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM96BQ9Y3D0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM96BQ9Y3D0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM96BQ9Y3D0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM96BQ9Y3D0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM96BQ9Y3D0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM96BQ9Y3D0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms