Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL20Q9Y2M5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL20Q9Y2M5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL20Q9Y2M5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL20Q9Y2M5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms