Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4Q9Y296 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC4Q9Y296 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4Q9Y296 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC4Q9Y296 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC4Q9Y296 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms