Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FARSAQ9Y285 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FARSAQ9Y285 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FARSAQ9Y285 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FARSAQ9Y285 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FARSAQ9Y285 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FARSAQ9Y285 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FARSAQ9Y285 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FARSAQ9Y285 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FARSAQ9Y285 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARSAQ9Y285 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FARSAQ9Y285 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FARSAQ9Y285 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FARSAQ9Y285 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARSAQ9Y285 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARSAQ9Y285 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARSAQ9Y285 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARSAQ9Y285 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARSAQ9Y285 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARSAQ9Y285 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARSAQ9Y285 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FARSAQ9Y285 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FARSAQ9Y285 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms