Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y255

PRELID1, PRELI domain-containing protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID1Q9Y255 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRELID1Q9Y255 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRELID1Q9Y255 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRELID1Q9Y255 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRELID1Q9Y255 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRELID1Q9Y255 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRELID1Q9Y255 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRELID1Q9Y255 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRELID1Q9Y255 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRELID1Q9Y255 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRELID1Q9Y255 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRELID1Q9Y255 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms