Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAF3IP3Q9Y228 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAF3IP3Q9Y228 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAF3IP3Q9Y228 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAF3IP3Q9Y228 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAF3IP3Q9Y228 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAF3IP3Q9Y228 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF3IP3Q9Y228 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAF3IP3Q9Y228 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRAF3IP3Q9Y228 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAF3IP3Q9Y228 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAF3IP3Q9Y228 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAF3IP3Q9Y228 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAF3IP3Q9Y228 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAF3IP3Q9Y228 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAF3IP3Q9Y228 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAF3IP3Q9Y228 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAF3IP3Q9Y228 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAF3IP3Q9Y228 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAF3IP3Q9Y228 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAF3IP3Q9Y228 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAF3IP3Q9Y228 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms