Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEU3Q9UQ49 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEU3Q9UQ49 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NEU3Q9UQ49 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NEU3Q9UQ49 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEU3Q9UQ49 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEU3Q9UQ49 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEU3Q9UQ49 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEU3Q9UQ49 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEU3Q9UQ49 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEU3Q9UQ49 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEU3Q9UQ49 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NEU3Q9UQ49 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEU3Q9UQ49 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NEU3Q9UQ49 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEU3Q9UQ49 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms