Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCML1Q9UN30 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCML1Q9UN30 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SCML1Q9UN30 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCML1Q9UN30 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCML1Q9UN30 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCML1Q9UN30 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCML1Q9UN30 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCML1Q9UN30 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCML1Q9UN30 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCML1Q9UN30 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCML1Q9UN30 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCML1Q9UN30 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCML1Q9UN30 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCML1Q9UN30 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCML1Q9UN30 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCML1Q9UN30 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCML1Q9UN30 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCML1Q9UN30 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCML1Q9UN30 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCML1Q9UN30 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCML1Q9UN30 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCML1Q9UN30 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCML1Q9UN30 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCML1Q9UN30 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCML1Q9UN30 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms