Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SARDHQ9UL12 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SARDHQ9UL12 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SARDHQ9UL12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SARDHQ9UL12 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SARDHQ9UL12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SARDHQ9UL12 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms