Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LSM7Q9UK45 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSM7Q9UK45 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LSM7Q9UK45 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LSM7Q9UK45 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LSM7Q9UK45 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LSM7Q9UK45 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LSM7Q9UK45 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LSM7Q9UK45 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LSM7Q9UK45 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSM7Q9UK45 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSM7Q9UK45 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSM7Q9UK45 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSM7Q9UK45 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSM7Q9UK45 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSM7Q9UK45 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSM7Q9UK45 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSM7Q9UK45 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSM7Q9UK45 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms