Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR3Q9UJK0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR3Q9UJK0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR3Q9UJK0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR3Q9UJK0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms