Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP25Q9UHP3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP25Q9UHP3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP25Q9UHP3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP25Q9UHP3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP25Q9UHP3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP25Q9UHP3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP25Q9UHP3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP25Q9UHP3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP25Q9UHP3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP25Q9UHP3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP25Q9UHP3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
USP25Q9UHP3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
USP25Q9UHP3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP25Q9UHP3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP25Q9UHP3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP25Q9UHP3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP25Q9UHP3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP25Q9UHP3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP25Q9UHP3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP25Q9UHP3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP25Q9UHP3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
USP25Q9UHP3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
USP25Q9UHP3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP25Q9UHP3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP25Q9UHP3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP25Q9UHP3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP25Q9UHP3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP25Q9UHP3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP25Q9UHP3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP25Q9UHP3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP25Q9UHP3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP25Q9UHP3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP25Q9UHP3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP25Q9UHP3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP25Q9UHP3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP25Q9UHP3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP25Q9UHP3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP25Q9UHP3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP25Q9UHP3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP25Q9UHP3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP25Q9UHP3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP25Q9UHP3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP25Q9UHP3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP25Q9UHP3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP25Q9UHP3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP25Q9UHP3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP25Q9UHP3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms