Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
IFT172Q9UG01 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
IFT172Q9UG01 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
IFT172Q9UG01 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
IFT172Q9UG01 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
IFT172Q9UG01 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
IFT172Q9UG01 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
IFT172Q9UG01 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
IFT172Q9UG01 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
IFT172Q9UG01 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
IFT172Q9UG01 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
IFT172Q9UG01 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
IFT172Q9UG01 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
IFT172Q9UG01 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT172Q9UG01 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT172Q9UG01 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
IFT172Q9UG01 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
IFT172Q9UG01 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
IFT172Q9UG01 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
IFT172Q9UG01 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.38■■■■□ 3.74
IFT172Q9UG01 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
IFT172Q9UG01 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
IFT172Q9UG01 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
IFT172Q9UG01 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
IFT172Q9UG01 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
IFT172Q9UG01 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
IFT172Q9UG01 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
IFT172Q9UG01 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
IFT172Q9UG01 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
IFT172Q9UG01 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
IFT172Q9UG01 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
IFT172Q9UG01 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
IFT172Q9UG01 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
IFT172Q9UG01 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
IFT172Q9UG01 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
IFT172Q9UG01 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
IFT172Q9UG01 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
IFT172Q9UG01 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT172Q9UG01 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT172Q9UG01 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT172Q9UG01 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
IFT172Q9UG01 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
IFT172Q9UG01 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
IFT172Q9UG01 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
IFT172Q9UG01 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
IFT172Q9UG01 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
IFT172Q9UG01 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
IFT172Q9UG01 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
IFT172Q9UG01 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
IFT172Q9UG01 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
IFT172Q9UG01 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
IFT172Q9UG01 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
IFT172Q9UG01 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
IFT172Q9UG01 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
IFT172Q9UG01 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
IFT172Q9UG01 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
IFT172Q9UG01 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
IFT172Q9UG01 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
IFT172Q9UG01 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
IFT172Q9UG01 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
IFT172Q9UG01 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
IFT172Q9UG01 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
IFT172Q9UG01 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
IFT172Q9UG01 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
IFT172Q9UG01 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
IFT172Q9UG01 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
IFT172Q9UG01 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
IFT172Q9UG01 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
IFT172Q9UG01 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
IFT172Q9UG01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
IFT172Q9UG01 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.09■■■■□ 3.69
IFT172Q9UG01 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
IFT172Q9UG01 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
IFT172Q9UG01 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
IFT172Q9UG01 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
IFT172Q9UG01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
IFT172Q9UG01 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
IFT172Q9UG01 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
IFT172Q9UG01 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
IFT172Q9UG01 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
IFT172Q9UG01 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
IFT172Q9UG01 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms