Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK7

RABL2A, Rab-like protein 2A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL2AQ9UBK7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABL2AQ9UBK7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RABL2AQ9UBK7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABL2AQ9UBK7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABL2AQ9UBK7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABL2AQ9UBK7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABL2AQ9UBK7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABL2AQ9UBK7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABL2AQ9UBK7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABL2AQ9UBK7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABL2AQ9UBK7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RABL2AQ9UBK7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABL2AQ9UBK7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABL2AQ9UBK7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABL2AQ9UBK7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABL2AQ9UBK7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms