Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBA8Q9NY65 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBA8Q9NY65 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA8Q9NY65 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA8Q9NY65 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA8Q9NY65 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA8Q9NY65 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA8Q9NY65 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA8Q9NY65 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA8Q9NY65 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBA8Q9NY65 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBA8Q9NY65 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBA8Q9NY65 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBA8Q9NY65 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA8Q9NY65 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBA8Q9NY65 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA8Q9NY65 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBA8Q9NY65 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
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