Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKBH4Q9NXW9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKBH4Q9NXW9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALKBH4Q9NXW9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALKBH4Q9NXW9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms