Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMPD4Q9NXE4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMPD4Q9NXE4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMPD4Q9NXE4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMPD4Q9NXE4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMPD4Q9NXE4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMPD4Q9NXE4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMPD4Q9NXE4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMPD4Q9NXE4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMPD4Q9NXE4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMPD4Q9NXE4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMPD4Q9NXE4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMPD4Q9NXE4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMPD4Q9NXE4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMPD4Q9NXE4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMPD4Q9NXE4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMPD4Q9NXE4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMPD4Q9NXE4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMPD4Q9NXE4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMPD4Q9NXE4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMPD4Q9NXE4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMPD4Q9NXE4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMPD4Q9NXE4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMPD4Q9NXE4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms