Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF2Q9NX18 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAF2Q9NX18 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF2Q9NX18 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF2Q9NX18 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF2Q9NX18 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF2Q9NX18 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms