Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRNAU1APQ9NX07 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRNAU1APQ9NX07 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRNAU1APQ9NX07 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRNAU1APQ9NX07 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRNAU1APQ9NX07 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRNAU1APQ9NX07 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms