Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BSDC1Q9NW68 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BSDC1Q9NW68 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
BSDC1Q9NW68 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BSDC1Q9NW68 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BSDC1Q9NW68 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
BSDC1Q9NW68 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BSDC1Q9NW68 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BSDC1Q9NW68 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BSDC1Q9NW68 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BSDC1Q9NW68 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
BSDC1Q9NW68 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
BSDC1Q9NW68 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BSDC1Q9NW68 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BSDC1Q9NW68 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
BSDC1Q9NW68 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BSDC1Q9NW68 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BSDC1Q9NW68 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BSDC1Q9NW68 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
BSDC1Q9NW68 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BSDC1Q9NW68 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BSDC1Q9NW68 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BSDC1Q9NW68 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BSDC1Q9NW68 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BSDC1Q9NW68 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BSDC1Q9NW68 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
BSDC1Q9NW68 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BSDC1Q9NW68 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BSDC1Q9NW68 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BSDC1Q9NW68 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BSDC1Q9NW68 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BSDC1Q9NW68 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BSDC1Q9NW68 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
BSDC1Q9NW68 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
BSDC1Q9NW68 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BSDC1Q9NW68 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BSDC1Q9NW68 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
BSDC1Q9NW68 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
BSDC1Q9NW68 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
BSDC1Q9NW68 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
BSDC1Q9NW68 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BSDC1Q9NW68 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
BSDC1Q9NW68 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
BSDC1Q9NW68 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
BSDC1Q9NW68 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BSDC1Q9NW68 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BSDC1Q9NW68 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms