Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.781e-6■■■□□ 16.9
STAU2Q9NUL3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.631e-6■■■□□ 16.9
STAU2Q9NUL3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41e-6■■■□□ 16.9
STAU2Q9NUL3 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.67■□□□□ 0.261e-6■■■□□ 16.9
STAU2Q9NUL3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.152e-6■■■□□ 16.9
STAU2Q9NUL3 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.112e-6■■■□□ 16.9
STAU2Q9NUL3 TNS1-217ENST00000490566 1652 ntTSL 210.83□□□□□ -0.683e-9■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.753e-9■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.64e-8■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.534e-8■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 KHSRP-202ENST00000594496 999 ntTSL 218.54■□□□□ 0.564e-8■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 KHSRP-205ENST00000595223 956 ntTSL 517.75■□□□□ 0.434e-8■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 KHSRP-203ENST00000594745 379 ntTSL 314.33□□□□□ -0.124e-8■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 KHSRP-208ENST00000597656 328 ntTSL 58.61□□□□□ -1.034e-8■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.936e-11■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.776e-11■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)16.12■□□□□ 0.176e-11■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.186e-11■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.551e-6■■■□□ 16.8
STAU2Q9NUL3 SEPT9-215ENST00000586521 601 ntTSL 418.13■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 16.7
STAU2Q9NUL3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.371e-6■■■□□ 16.7
STAU2Q9NUL3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.291e-6■■■□□ 16.7
STAU2Q9NUL3 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 16.7
STAU2Q9NUL3 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-6■■■□□ 16.7
STAU2Q9NUL3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 16.7
STAU2Q9NUL3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 16.7
STAU2Q9NUL3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 16.7
STAU2Q9NUL3 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 16.7
STAU2Q9NUL3 MIR3177-201ENST00000578255 82 ntBASIC12.8□□□□□ -0.364e-7■■■□□ 16.6
STAU2Q9NUL3 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 227■■□□□ 1.913e-6■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 327■■□□□ 1.913e-6■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.583e-6■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 ELL-204ENST00000596915 623 ntTSL 316.22■□□□□ 0.195e-6■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.342e-6■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.43■□□□□ 0.862e-6■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-6■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.712e-6■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 518.32■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.942e-13■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.392e-13■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 TXNDC5-202ENST00000460138 2704 ntTSL 211.01□□□□□ -0.652e-13■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 ISM2-201ENST00000216481 3045 ntTSL 214.1□□□□□ -0.154e-6■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.364e-6■■■□□ 16.5
STAU2Q9NUL3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.551e-6■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.46e-8■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.351e-6■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 ATXN2-204ENST00000392645 2842 ntTSL 215.15■□□□□ 0.021e-6■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 ATXN2-218ENST00000549455 568 ntTSL 414.45□□□□□ -0.11e-6■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.26e-8■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 ATXN2-210ENST00000483311 4159 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.431e-6■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.766e-8■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.211e-6■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.411e-6■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.441e-6■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 ATXN2-217ENST00000548492 556 ntTSL 45□□□□□ -1.611e-6■■■□□ 16.3
STAU2Q9NUL3 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 521.59■■□□□ 1.053e-6■■■□□ 16.2
STAU2Q9NUL3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.443e-6■■■□□ 16.2
STAU2Q9NUL3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 16.2
STAU2Q9NUL3 SDC1-205ENST00000447124 591 ntTSL 420.9■□□□□ 0.942e-6■■■□□ 16.2
STAU2Q9NUL3 SDC1-204ENST00000429035 646 ntTSL 314.54□□□□□ -0.082e-6■■■□□ 16.2
STAU2Q9NUL3 SDC1-206ENST00000482879 558 ntTSL 412.66□□□□□ -0.382e-6■■■□□ 16.2
STAU2Q9NUL3 VAV2-205ENST00000486113 523 ntTSL 212.86□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 16.1
STAU2Q9NUL3 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 16
STAU2Q9NUL3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.092e-6■■■□□ 16
STAU2Q9NUL3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.253e-6■■■□□ 16
STAU2Q9NUL3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.313e-6■■■□□ 16
STAU2Q9NUL3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.224e-6■■■□□ 15.9
STAU2Q9NUL3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.084e-6■■■□□ 15.9
STAU2Q9NUL3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.034e-6■■■□□ 15.9
STAU2Q9NUL3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.924e-6■■■□□ 15.9
STAU2Q9NUL3 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 320.39■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 15.9
STAU2Q9NUL3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.74e-6■■■□□ 15.9
STAU2Q9NUL3 ZGPAT-207ENST00000468235 594 ntTSL 1 (best)18.28■□□□□ 0.524e-6■■■□□ 15.9
STAU2Q9NUL3 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 217.3■□□□□ 0.364e-6■■■□□ 15.9
STAU2Q9NUL3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.314e-6■■■□□ 15.9
STAU2Q9NUL3 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 216.46■□□□□ 0.224e-6■■■□□ 15.9
STAU2Q9NUL3 GAK-211ENST00000509566 3126 ntTSL 215.39■□□□□ 0.052e-6■■■□□ 15.8
STAU2Q9NUL3 GINS1-201ENST00000262460 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.951e-8■■■□□ 15.8
STAU2Q9NUL3 GINS1-203ENST00000481735 396 ntTSL 36.21□□□□□ -1.421e-8■■■□□ 15.8
STAU2Q9NUL3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.14e-6■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.994e-6■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.764e-6■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.959e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.839e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 519.24■□□□□ 0.679e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 417.89■□□□□ 0.459e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.39e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.359e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.99e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 56.13□□□□□ -1.439e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 54.5□□□□□ -1.699e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 33.67□□□□□ -1.829e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 33.02□□□□□ -1.939e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 PIGT-269ENST00000640692 1948 ntTSL 518.5■□□□□ 0.552e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 PIGT-222ENST00000638612 2311 ntTSL 517.55■□□□□ 0.42e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 PIGT-206ENST00000455050 1807 ntTSL 217.55■□□□□ 0.42e-7■■■□□ 15.7
STAU2Q9NUL3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-7■■■□□ 15.7
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