Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.318e-20■■■■■ 40.4
STAU2Q9NUL3 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.21□□□□□ -0.133e-11■■■■■ 35.5
STAU2Q9NUL3 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.53□□□□□ -0.563e-11■■■■■ 35.5
STAU2Q9NUL3 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.44□□□□□ -0.583e-11■■■■■ 35.5
STAU2Q9NUL3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.063e-22■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.523e-22■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.353e-22■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 NUTF2-208ENST00000587481 2608 nt9.9□□□□□ -0.823e-22■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-213ENST00000565834 1671 ntTSL 519.52■□□□□ 0.713e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-208ENST00000563220 1897 ntTSL 218.85■□□□□ 0.613e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.233e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-206ENST00000562610 850 ntTSL 316.46■□□□□ 0.233e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-215ENST00000566843 2284 ntTSL 216.17■□□□□ 0.183e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.153e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-221ENST00000567935 502 ntTSL 315.2■□□□□ 0.023e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-225ENST00000569245 867 ntTSL 214.68□□□□□ -0.063e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.153e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.153e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.153e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-209ENST00000564068 4204 nt13.12□□□□□ -0.313e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 COMMD4-203ENST00000480484 3225 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 33.7
STAU2Q9NUL3 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.318e-10■■■■■ 32.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-209ENST00000575090 752 ntTSL 322.84■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 31.2
STAU2Q9NUL3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.073e-9■■■■■ 30.8
STAU2Q9NUL3 H2AFX-201ENST00000375167 1373 ntTSL 216.64■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 30.8
STAU2Q9NUL3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.245e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.95e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.865e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.855e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 Z98883.1-201ENST00000409439 916 ntTSL 320.36■□□□□ 0.855e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-202ENST00000293874 603 ntTSL 419.38■□□□□ 0.695e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.615e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-207ENST00000439574 586 ntTSL 318.51■□□□□ 0.555e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.385e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.375e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.35e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 516.74■□□□□ 0.275e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 516.46■□□□□ 0.235e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.145e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.325e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 MINK1-213ENST00000577021 675 ntTSL 59.66□□□□□ -0.865e-9■■■■■ 29.4
STAU2Q9NUL3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 28.2
STAU2Q9NUL3 RHBG-208ENST00000620376 1984 ntTSL 222.86■■□□□ 1.251e-8■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 RHBG-201ENST00000451864 1927 ntTSL 222.31■■□□□ 1.161e-8■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.441e-8■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 RHBG-205ENST00000612897 1862 ntTSL 1 (best)17.63■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 RHBG-206ENST00000613460 1912 ntTSL 1 (best)14.6□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 RHBG-207ENST00000618120 2424 ntTSL 214.08□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.383e-9■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 DNAJA3-212ENST00000576180 2288 ntTSL 213.74□□□□□ -0.213e-9■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 DNAJA3-209ENST00000574393 577 ntTSL 313.11□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 27.9
STAU2Q9NUL3 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 27.1
STAU2Q9NUL3 CAPN15-205ENST00000567216 3174 ntTSL 1 (best)20.78■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 26.9
STAU2Q9NUL3 CNN2-209ENST00000568865 1332 ntTSL 519.52■□□□□ 0.725e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-212ENST00000607102 307 ntTSL 1 (best)16.76■□□□□ 0.275e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-210ENST00000569352 731 ntTSL 515.44■□□□□ 0.065e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.015e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.015e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-204ENST00000562075 623 ntTSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.025e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.075e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-208ENST00000566695 828 ntTSL 212.49□□□□□ -0.415e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.415e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CNN2-211ENST00000606983 537 ntTSL 311.66□□□□□ -0.545e-8■■■■□ 26.5
STAU2Q9NUL3 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.72e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-212ENST00000480007 569 ntTSL 49.45□□□□□ -0.92e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 59.35□□□□□ -0.912e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.962e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -12e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-211ENST00000474065 516 ntTSL 37.86□□□□□ -1.152e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-205ENST00000430234 582 ntTSL 47.19□□□□□ -1.262e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-206ENST00000449975 555 ntTSL 45.38□□□□□ -1.552e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CLASP1-204ENST00000418989 663 ntTSL 45.26□□□□□ -1.572e-8■■■■□ 25.6
STAU2Q9NUL3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.584e-10■■■■□ 25.4
STAU2Q9NUL3 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.674e-10■■■■□ 25.4
STAU2Q9NUL3 MSI2-210ENST00000579505 577 ntTSL 318.4■□□□□ 0.541e-7■■■■□ 25.1
STAU2Q9NUL3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.221e-7■■■■□ 25.1
STAU2Q9NUL3 MSI2-207ENST00000579205 500 ntTSL 415.42■□□□□ 0.061e-7■■■■□ 25.1
STAU2Q9NUL3 FZR1-207ENST00000591290 1331 ntTSL 520.17■□□□□ 0.823e-7■■■■□ 24.3
STAU2Q9NUL3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-7■■■■□ 24.3
STAU2Q9NUL3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.533e-7■■■■□ 24.3
STAU2Q9NUL3 FZR1-208ENST00000592214 598 ntTSL 315.69■□□□□ 0.13e-7■■■■□ 24.3
STAU2Q9NUL3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.013e-7■■■■□ 24.3
STAU2Q9NUL3 SH3BP4-204ENST00000416021 593 ntTSL 321.49■■□□□ 1.032e-6■■■■□ 24
STAU2Q9NUL3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 24
STAU2Q9NUL3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.646e-7■■■■□ 23.9
STAU2Q9NUL3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 23.9
STAU2Q9NUL3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.216e-7■■■■□ 23.9
Retrieved 100 of 1,542 protein–RNA pairs in 25.9 ms