RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555855.5

FOXN3-211, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-211ENST00000555855 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.74■■■■■ 5.39
FOXN3-211ENST00000555855 ABCC9O60706 1549 aa44.14■■■■■ 4.66
FOXN3-211ENST00000555855 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.78■■■■■ 4.6
FOXN3-211ENST00000555855 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.89■■■■■ 4.3
FOXN3-211ENST00000555855 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.68■■■■■ 4.26
FOXN3-211ENST00000555855 NACADO15069 1562 aa41.54■■■■■ 4.24
FOXN3-211ENST00000555855 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.52■■■■■ 4.24
FOXN3-211ENST00000555855 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.15■■■■■ 4.18
FOXN3-211ENST00000555855 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.85■■■■■ 4.13
FOXN3-211ENST00000555855 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.81■■■■■ 4.12
FOXN3-211ENST00000555855 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.59■■■■■ 4.09
FOXN3-211ENST00000555855 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
FOXN3-211ENST00000555855 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.22■■■■■ 4.03
FOXN3-211ENST00000555855 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.07■■■■■ 4
FOXN3-211ENST00000555855 SCRIBQ14160 1630 aa39.91■■■■□ 3.98
FOXN3-211ENST00000555855 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.81■■■■□ 3.96
FOXN3-211ENST00000555855 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.81■■■■□ 3.96
FOXN3-211ENST00000555855 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
FOXN3-211ENST00000555855 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.55■■■■□ 3.76
FOXN3-211ENST00000555855 NCAPD3P42695 1498 aa38.37■■■■□ 3.73
FOXN3-211ENST00000555855 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.2■■■■□ 3.71
FOXN3-211ENST00000555855 ERCC6Q03468 1493 aa38.19■■■■□ 3.7
FOXN3-211ENST00000555855 CUX2O14529 1486 aa38.15■■■■□ 3.7
FOXN3-211ENST00000555855 SMARCA2P51531 1590 aa38.08■■■■□ 3.69
FOXN3-211ENST00000555855 SMARCA4P51532 1647 aa38.04■■■■□ 3.68
FOXN3-211ENST00000555855 HMGXB3Q12766 1538 aa37.99■■■■□ 3.67
FOXN3-211ENST00000555855 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
FOXN3-211ENST00000555855 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
FOXN3-211ENST00000555855 NESP48681 1621 aa37.81■■■■□ 3.64
FOXN3-211ENST00000555855 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.65■■■■□ 3.62
FOXN3-211ENST00000555855 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.54■■■■□ 3.6
FOXN3-211ENST00000555855 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.51■■■■□ 3.6
FOXN3-211ENST00000555855 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.41■■■■□ 3.58
FOXN3-211ENST00000555855 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
FOXN3-211ENST00000555855 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.26■■■■□ 3.56
FOXN3-211ENST00000555855 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.24■■■■□ 3.55
FOXN3-211ENST00000555855 WIZO95785 1651 aa37.05■■■■□ 3.52
FOXN3-211ENST00000555855 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.01■■■■□ 3.52
FOXN3-211ENST00000555855 WDR62O43379 1518 aa36.88■■■■□ 3.49
FOXN3-211ENST00000555855 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.83■■■■□ 3.49
FOXN3-211ENST00000555855 TRIM41Q8WV44 630 aa36.79■■■■□ 3.48
FOXN3-211ENST00000555855 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.76■■■■□ 3.48
FOXN3-211ENST00000555855 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
FOXN3-211ENST00000555855 CFTRP13569 1480 aa36.69■■■■□ 3.46
FOXN3-211ENST00000555855 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
FOXN3-211ENST00000555855 OSCARQ8IYS5 282 aa36.54■■■■□ 3.44
FOXN3-211ENST00000555855 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
FOXN3-211ENST00000555855 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.22■■■■□ 3.39
FOXN3-211ENST00000555855 PRDM2Q13029 1718 aa36.2■■■■□ 3.39
FOXN3-211ENST00000555855 IFT140Q96RY7 1462 aa36.12■■■■□ 3.37
FOXN3-211ENST00000555855 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
FOXN3-211ENST00000555855 TOPBP1Q92547 1522 aa36.02■■■■□ 3.36
FOXN3-211ENST00000555855 ABCC8Q09428 1581 aa36.02■■■■□ 3.36
FOXN3-211ENST00000555855 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.87■■■■□ 3.33
FOXN3-211ENST00000555855 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.87■■■■□ 3.33
FOXN3-211ENST00000555855 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.87■■■■□ 3.33
FOXN3-211ENST00000555855 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.85■■■■□ 3.33
FOXN3-211ENST00000555855 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
FOXN3-211ENST00000555855 ARHGEF11O15085 1522 aa35.75■■■■□ 3.31
FOXN3-211ENST00000555855 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.74■■■■□ 3.31
FOXN3-211ENST00000555855 FBLN2P98095 1184 aa35.71■■■■□ 3.31
FOXN3-211ENST00000555855 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.69■■■■□ 3.3
FOXN3-211ENST00000555855 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
FOXN3-211ENST00000555855 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
FOXN3-211ENST00000555855 CHD1O14646 1710 aa35.57■■■■□ 3.28
FOXN3-211ENST00000555855 SOGA1O94964 1423 aa35.56■■■■□ 3.28
FOXN3-211ENST00000555855 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.53■■■■□ 3.28
FOXN3-211ENST00000555855 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
FOXN3-211ENST00000555855 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
FOXN3-211ENST00000555855 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
FOXN3-211ENST00000555855 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.37■■■■□ 3.25
FOXN3-211ENST00000555855 ARAP1Q96P48 1450 aa35.37■■■■□ 3.25
FOXN3-211ENST00000555855 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.32■■■■□ 3.24
FOXN3-211ENST00000555855 WDR97A6NE52 1622 aa35.32■■■■□ 3.24
FOXN3-211ENST00000555855 CUX1P39880 1505 aa35.27■■■■□ 3.24
FOXN3-211ENST00000555855 GRIN2BQ13224 1484 aa35.24■■■■□ 3.23
FOXN3-211ENST00000555855 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
FOXN3-211ENST00000555855 SYNJ1O43426 1573 aa35.19■■■■□ 3.22
FOXN3-211ENST00000555855 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.15■■■■□ 3.22
FOXN3-211ENST00000555855 SYNJ2O15056 1496 aa35.13■■■■□ 3.21
FOXN3-211ENST00000555855 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.09■■■■□ 3.21
FOXN3-211ENST00000555855 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
FOXN3-211ENST00000555855 PBRM1Q86U86 1689 aa34.96■■■■□ 3.19
FOXN3-211ENST00000555855 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.96■■■■□ 3.19
FOXN3-211ENST00000555855 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.85■■■■□ 3.17
FOXN3-211ENST00000555855 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.84■■■■□ 3.17
FOXN3-211ENST00000555855 GRIN2AQ12879 1464 aa34.74■■■■□ 3.15
FOXN3-211ENST00000555855 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.64■■■■□ 3.14
FOXN3-211ENST00000555855 TOP2BQ02880 1626 aa34.63■■■■□ 3.13
FOXN3-211ENST00000555855 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
FOXN3-211ENST00000555855 NUP160Q12769 1436 aa34.63■■■■□ 3.13
FOXN3-211ENST00000555855 ADAMTS12P58397 1594 aa34.62■■■■□ 3.13
FOXN3-211ENST00000555855 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.61■■■■□ 3.13
FOXN3-211ENST00000555855 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.58■■■■□ 3.13
FOXN3-211ENST00000555855 CEP170Q5SW79 1584 aa34.57■■■■□ 3.13
FOXN3-211ENST00000555855 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.52■■■■□ 3.12
FOXN3-211ENST00000555855 JPH4Q96JJ6 628 aa34.44■■■■□ 3.1
FOXN3-211ENST00000555855 SHROOM2Q13796 1616 aa34.44■■■■□ 3.1
FOXN3-211ENST00000555855 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
FOXN3-211ENST00000555855 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 190 ms