RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 NISCHQ9Y2I1 1504 aa17.62■□□□□ 0.41
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GINS1-201ENST00000262460 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.71□□□□□ -0.05
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GINS1-201ENST00000262460 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14□□□□□ -0.17
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GINS1-201ENST00000262460 NACADO15069 1562 aa13.66□□□□□ -0.22
GINS1-201ENST00000262460 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
GINS1-201ENST00000262460 ABCC8Q09428 1581 aa13.63□□□□□ -0.23
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GINS1-201ENST00000262460 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
GINS1-201ENST00000262460 SMARCA2P51531 1590 aa13.37□□□□□ -0.27
GINS1-201ENST00000262460 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.37□□□□□ -0.27
GINS1-201ENST00000262460 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
GINS1-201ENST00000262460 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
GINS1-201ENST00000262460 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
GINS1-201ENST00000262460 CEP162Q5TB80 1403 aa13.35□□□□□ -0.27
GINS1-201ENST00000262460 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
GINS1-201ENST00000262460 BICRAQ9NZM4 1560 aa13.26□□□□□ -0.29
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GINS1-201ENST00000262460 TNIKQ9UKE5 1360 aa13.19□□□□□ -0.3
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GINS1-201ENST00000262460 CEP164Q9UPV0 1460 aa13□□□□□ -0.33
GINS1-201ENST00000262460 MIER1Q8N108 512 aa13□□□□□ -0.33
GINS1-201ENST00000262460 P3H3Q8IVL6 736 aa13□□□□□ -0.33
GINS1-201ENST00000262460 EEA1Q15075 1411 aa12.99□□□□□ -0.33
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GINS1-201ENST00000262460 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.93□□□□□ -0.34
GINS1-201ENST00000262460 PEG3Q9GZU2 1588 aa12.92□□□□□ -0.34
GINS1-201ENST00000262460 KIF21BO75037 1637 aa12.91□□□□□ -0.34
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GINS1-201ENST00000262460 ARID3CA6NKF2 412 aa12.74□□□□□ -0.37
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GINS1-201ENST00000262460 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.69□□□□□ -0.38
GINS1-201ENST00000262460 NESP48681 1621 aa12.69□□□□□ -0.38
GINS1-201ENST00000262460 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.68□□□□□ -0.38
GINS1-201ENST00000262460 CCNB3Q8WWL7 1395 aa12.67□□□□□ -0.38
GINS1-201ENST00000262460 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.67□□□□□ -0.38
GINS1-201ENST00000262460 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.65□□□□□ -0.38
GINS1-201ENST00000262460 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.64□□□□□ -0.39
GINS1-201ENST00000262460 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.64□□□□□ -0.39
GINS1-201ENST00000262460 HMGXB3Q12766 1538 aa12.63□□□□□ -0.39
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