RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486113.1

VAV2-205, Transcript of vav guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

TSL 2

Gene VAV2, Length 523 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2-205ENST00000486113 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.99■■■□□ 2.55
VAV2-205ENST00000486113 ABCC9O60706 1549 aa27.78■■■□□ 2.04
VAV2-205ENST00000486113 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.68■■■□□ 2.02
VAV2-205ENST00000486113 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.71■■□□□ 1.87
VAV2-205ENST00000486113 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.16■■□□□ 1.78
VAV2-205ENST00000486113 NACADO15069 1562 aa26.08■■□□□ 1.77
VAV2-205ENST00000486113 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.92■■□□□ 1.74
VAV2-205ENST00000486113 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.91■■□□□ 1.74
VAV2-205ENST00000486113 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
VAV2-205ENST00000486113 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
VAV2-205ENST00000486113 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.72■■□□□ 1.71
VAV2-205ENST00000486113 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.38■■□□□ 1.65
VAV2-205ENST00000486113 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.27■■□□□ 1.64
VAV2-205ENST00000486113 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.2■■□□□ 1.62
VAV2-205ENST00000486113 SCRIBQ14160 1630 aa25.15■■□□□ 1.62
VAV2-205ENST00000486113 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.09■■□□□ 1.61
VAV2-205ENST00000486113 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.08■■□□□ 1.61
VAV2-205ENST00000486113 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.96■■□□□ 1.59
VAV2-205ENST00000486113 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
VAV2-205ENST00000486113 CUX2O14529 1486 aa24.18■■□□□ 1.46
VAV2-205ENST00000486113 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
VAV2-205ENST00000486113 ERCC6Q03468 1493 aa24.08■■□□□ 1.45
VAV2-205ENST00000486113 SMARCA4P51532 1647 aa24.08■■□□□ 1.45
VAV2-205ENST00000486113 NCAPD3P42695 1498 aa24.06■■□□□ 1.44
VAV2-205ENST00000486113 SMARCA2P51531 1590 aa24.03■■□□□ 1.44
VAV2-205ENST00000486113 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24■■□□□ 1.43
VAV2-205ENST00000486113 HMGXB3Q12766 1538 aa23.94■■□□□ 1.42
VAV2-205ENST00000486113 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.89■■□□□ 1.41
VAV2-205ENST00000486113 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.82■■□□□ 1.4
VAV2-205ENST00000486113 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
VAV2-205ENST00000486113 TRIM41Q8WV44 630 aa23.82■■□□□ 1.4
VAV2-205ENST00000486113 NESP48681 1621 aa23.61■■□□□ 1.37
VAV2-205ENST00000486113 WIZO95785 1651 aa23.53■■□□□ 1.36
VAV2-205ENST00000486113 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
VAV2-205ENST00000486113 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.46■■□□□ 1.35
VAV2-205ENST00000486113 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
VAV2-205ENST00000486113 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
VAV2-205ENST00000486113 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.34■■□□□ 1.33
VAV2-205ENST00000486113 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.33■■□□□ 1.33
VAV2-205ENST00000486113 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.18■■□□□ 1.3
VAV2-205ENST00000486113 CFTRP13569 1480 aa23.16■■□□□ 1.3
VAV2-205ENST00000486113 OSCARQ8IYS5 282 aa23.11■■□□□ 1.29
VAV2-205ENST00000486113 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.07■■□□□ 1.28
VAV2-205ENST00000486113 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.07■■□□□ 1.28
VAV2-205ENST00000486113 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.05■■□□□ 1.28
VAV2-205ENST00000486113 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.05■■□□□ 1.28
VAV2-205ENST00000486113 WDR62O43379 1518 aa22.98■■□□□ 1.27
VAV2-205ENST00000486113 PRDM2Q13029 1718 aa22.92■■□□□ 1.26
VAV2-205ENST00000486113 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
VAV2-205ENST00000486113 ABCC8Q09428 1581 aa22.75■■□□□ 1.23
VAV2-205ENST00000486113 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
VAV2-205ENST00000486113 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.71■■□□□ 1.23
VAV2-205ENST00000486113 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.71■■□□□ 1.23
VAV2-205ENST00000486113 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.71■■□□□ 1.23
VAV2-205ENST00000486113 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
VAV2-205ENST00000486113 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.65■■□□□ 1.22
VAV2-205ENST00000486113 TOPBP1Q92547 1522 aa22.65■■□□□ 1.22
VAV2-205ENST00000486113 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.63■■□□□ 1.21
VAV2-205ENST00000486113 IFT140Q96RY7 1462 aa22.61■■□□□ 1.21
VAV2-205ENST00000486113 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
VAV2-205ENST00000486113 ARHGEF11O15085 1522 aa22.59■■□□□ 1.21
VAV2-205ENST00000486113 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
VAV2-205ENST00000486113 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
VAV2-205ENST00000486113 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
VAV2-205ENST00000486113 CUX1P39880 1505 aa22.37■■□□□ 1.17
VAV2-205ENST00000486113 FBLN2P98095 1184 aa22.37■■□□□ 1.17
VAV2-205ENST00000486113 SOGA1O94964 1423 aa22.37■■□□□ 1.17
VAV2-205ENST00000486113 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.36■■□□□ 1.17
VAV2-205ENST00000486113 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
VAV2-205ENST00000486113 WDR97A6NE52 1622 aa22.34■■□□□ 1.17
VAV2-205ENST00000486113 ARAP1Q96P48 1450 aa22.31■■□□□ 1.16
VAV2-205ENST00000486113 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.29■■□□□ 1.16
VAV2-205ENST00000486113 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 29
VAV2-205ENST00000486113 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
VAV2-205ENST00000486113 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
VAV2-205ENST00000486113 TOP2BQ02880 1626 aa22.18■■□□□ 1.14
VAV2-205ENST00000486113 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.17■■□□□ 1.14
VAV2-205ENST00000486113 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.16■■□□□ 1.14
VAV2-205ENST00000486113 GRIN2BQ13224 1484 aa22.16■■□□□ 1.14
VAV2-205ENST00000486113 CHD1O14646 1710 aa22.15■■□□□ 1.14
VAV2-205ENST00000486113 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
VAV2-205ENST00000486113 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.11■■□□□ 1.13
VAV2-205ENST00000486113 SYNJ1O43426 1573 aa22.11■■□□□ 1.13
VAV2-205ENST00000486113 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.1■■□□□ 1.13
VAV2-205ENST00000486113 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.06■■□□□ 1.12
VAV2-205ENST00000486113 SYNJ2O15056 1496 aa22.03■■□□□ 1.12
VAV2-205ENST00000486113 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
VAV2-205ENST00000486113 PBRM1Q86U86 1689 aa22.01■■□□□ 1.11
VAV2-205ENST00000486113 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.92■■□□□ 1.1
VAV2-205ENST00000486113 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.9■■□□□ 1.1
VAV2-205ENST00000486113 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.88■■□□□ 1.09
VAV2-205ENST00000486113 ADAMTS12P58397 1594 aa21.87■■□□□ 1.09
VAV2-205ENST00000486113 GRIN2AQ12879 1464 aa21.85■■□□□ 1.09
VAV2-205ENST00000486113 KIF27Q86VH2 1401 aa21.81■■□□□ 1.08
VAV2-205ENST00000486113 NUP160Q12769 1436 aa21.77■■□□□ 1.08
VAV2-205ENST00000486113 CEP170Q5SW79 1584 aa21.7■■□□□ 1.06
VAV2-205ENST00000486113 CUL7Q14999 1698 aa21.69■■□□□ 1.06
VAV2-205ENST00000486113 IGF1RP08069 1367 aa21.68■■□□□ 1.06
VAV2-205ENST00000486113 SHROOM2Q13796 1616 aa21.6■■□□□ 1.05
VAV2-205ENST00000486113 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.6 ms