Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3GQ9NS98 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3GQ9NS98 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3GQ9NS98 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3GQ9NS98 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3GQ9NS98 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3GQ9NS98 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3GQ9NS98 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3GQ9NS98 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3GQ9NS98 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3GQ9NS98 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3GQ9NS98 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3GQ9NS98 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3GQ9NS98 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3GQ9NS98 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3GQ9NS98 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3GQ9NS98 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3GQ9NS98 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3GQ9NS98 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3GQ9NS98 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3GQ9NS98 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3GQ9NS98 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3GQ9NS98 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3GQ9NS98 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3GQ9NS98 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3GQ9NS98 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3GQ9NS98 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3GQ9NS98 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3GQ9NS98 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms