Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SEMA3GQ9NS98 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEMA3GQ9NS98 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SEMA3GQ9NS98 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SEMA3GQ9NS98 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SEMA3GQ9NS98 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SEMA3GQ9NS98 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SEMA3GQ9NS98 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SEMA3GQ9NS98 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SEMA3GQ9NS98 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEMA3GQ9NS98 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SEMA3GQ9NS98 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEMA3GQ9NS98 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEMA3GQ9NS98 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEMA3GQ9NS98 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEMA3GQ9NS98 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SEMA3GQ9NS98 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEMA3GQ9NS98 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3GQ9NS98 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEMA3GQ9NS98 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEMA3GQ9NS98 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEMA3GQ9NS98 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA3GQ9NS98 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEMA3GQ9NS98 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEMA3GQ9NS98 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3GQ9NS98 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA3GQ9NS98 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3GQ9NS98 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SEMA3GQ9NS98 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA3GQ9NS98 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA3GQ9NS98 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEMA3GQ9NS98 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEMA3GQ9NS98 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEMA3GQ9NS98 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEMA3GQ9NS98 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA3GQ9NS98 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA3GQ9NS98 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEMA3GQ9NS98 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEMA3GQ9NS98 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA3GQ9NS98 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA3GQ9NS98 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEMA3GQ9NS98 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA3GQ9NS98 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3GQ9NS98 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEMA3GQ9NS98 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3GQ9NS98 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA3GQ9NS98 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA3GQ9NS98 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA3GQ9NS98 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA3GQ9NS98 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA3GQ9NS98 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA3GQ9NS98 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3GQ9NS98 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA3GQ9NS98 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA3GQ9NS98 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3GQ9NS98 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3GQ9NS98 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA3GQ9NS98 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA3GQ9NS98 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA3GQ9NS98 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA3GQ9NS98 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3GQ9NS98 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA3GQ9NS98 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA3GQ9NS98 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3GQ9NS98 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3GQ9NS98 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3GQ9NS98 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3GQ9NS98 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3GQ9NS98 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3GQ9NS98 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3GQ9NS98 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3GQ9NS98 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3GQ9NS98 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3GQ9NS98 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3GQ9NS98 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEMA3GQ9NS98 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3GQ9NS98 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3GQ9NS98 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3GQ9NS98 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3GQ9NS98 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3GQ9NS98 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3GQ9NS98 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3GQ9NS98 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3GQ9NS98 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3GQ9NS98 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3GQ9NS98 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3GQ9NS98 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEMA3GQ9NS98 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA3GQ9NS98 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3GQ9NS98 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3GQ9NS98 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3GQ9NS98 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3GQ9NS98 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3GQ9NS98 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3GQ9NS98 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3GQ9NS98 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3GQ9NS98 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3GQ9NS98 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3GQ9NS98 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3GQ9NS98 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms