Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TULP4Q9NRJ4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TULP4Q9NRJ4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TULP4Q9NRJ4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TULP4Q9NRJ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TULP4Q9NRJ4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TULP4Q9NRJ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
TULP4Q9NRJ4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
TULP4Q9NRJ4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
TULP4Q9NRJ4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TULP4Q9NRJ4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TULP4Q9NRJ4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TULP4Q9NRJ4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TULP4Q9NRJ4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TULP4Q9NRJ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TULP4Q9NRJ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TULP4Q9NRJ4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TULP4Q9NRJ4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TULP4Q9NRJ4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TULP4Q9NRJ4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
TULP4Q9NRJ4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TULP4Q9NRJ4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TULP4Q9NRJ4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TULP4Q9NRJ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TULP4Q9NRJ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TULP4Q9NRJ4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TULP4Q9NRJ4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TULP4Q9NRJ4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TULP4Q9NRJ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TULP4Q9NRJ4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TULP4Q9NRJ4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TULP4Q9NRJ4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TULP4Q9NRJ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TULP4Q9NRJ4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TULP4Q9NRJ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TULP4Q9NRJ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
TULP4Q9NRJ4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TULP4Q9NRJ4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TULP4Q9NRJ4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TULP4Q9NRJ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TULP4Q9NRJ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TULP4Q9NRJ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
TULP4Q9NRJ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TULP4Q9NRJ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TULP4Q9NRJ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TULP4Q9NRJ4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TULP4Q9NRJ4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TULP4Q9NRJ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TULP4Q9NRJ4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TULP4Q9NRJ4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TULP4Q9NRJ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TULP4Q9NRJ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TULP4Q9NRJ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TULP4Q9NRJ4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TULP4Q9NRJ4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TULP4Q9NRJ4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TULP4Q9NRJ4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TULP4Q9NRJ4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TULP4Q9NRJ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TULP4Q9NRJ4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TULP4Q9NRJ4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TULP4Q9NRJ4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TULP4Q9NRJ4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
TULP4Q9NRJ4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TULP4Q9NRJ4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TULP4Q9NRJ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TULP4Q9NRJ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TULP4Q9NRJ4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TULP4Q9NRJ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
TULP4Q9NRJ4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TULP4Q9NRJ4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TULP4Q9NRJ4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TULP4Q9NRJ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TULP4Q9NRJ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TULP4Q9NRJ4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TULP4Q9NRJ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TULP4Q9NRJ4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TULP4Q9NRJ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
TULP4Q9NRJ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
TULP4Q9NRJ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TULP4Q9NRJ4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TULP4Q9NRJ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TULP4Q9NRJ4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TULP4Q9NRJ4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TULP4Q9NRJ4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TULP4Q9NRJ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms