Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP4Q9H3Q1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP4Q9H3Q1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP4Q9H3Q1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP4Q9H3Q1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP4Q9H3Q1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC42EP4Q9H3Q1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP4Q9H3Q1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP4Q9H3Q1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP4Q9H3Q1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP4Q9H3Q1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP4Q9H3Q1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP4Q9H3Q1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP4Q9H3Q1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP4Q9H3Q1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP4Q9H3Q1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC42EP4Q9H3Q1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC42EP4Q9H3Q1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP4Q9H3Q1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDC42EP4Q9H3Q1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC42EP4Q9H3Q1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC42EP4Q9H3Q1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP4Q9H3Q1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP4Q9H3Q1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP4Q9H3Q1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP4Q9H3Q1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP4Q9H3Q1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP4Q9H3Q1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP4Q9H3Q1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP4Q9H3Q1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDC42EP4Q9H3Q1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP4Q9H3Q1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP4Q9H3Q1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP4Q9H3Q1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP4Q9H3Q1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP4Q9H3Q1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP4Q9H3Q1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP4Q9H3Q1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms