Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C2

ARV1, Protein ARV1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARV1Q9H2C2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARV1Q9H2C2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARV1Q9H2C2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARV1Q9H2C2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARV1Q9H2C2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARV1Q9H2C2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARV1Q9H2C2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARV1Q9H2C2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARV1Q9H2C2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARV1Q9H2C2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARV1Q9H2C2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARV1Q9H2C2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARV1Q9H2C2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARV1Q9H2C2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARV1Q9H2C2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARV1Q9H2C2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARV1Q9H2C2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARV1Q9H2C2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARV1Q9H2C2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARV1Q9H2C2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARV1Q9H2C2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARV1Q9H2C2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARV1Q9H2C2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARV1Q9H2C2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARV1Q9H2C2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms