Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIK2Q9H0K1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIK2Q9H0K1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIK2Q9H0K1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK2Q9H0K1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK2Q9H0K1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIK2Q9H0K1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK2Q9H0K1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK2Q9H0K1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK2Q9H0K1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK2Q9H0K1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK2Q9H0K1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SIK2Q9H0K1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIK2Q9H0K1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIK2Q9H0K1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK2Q9H0K1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK2Q9H0K1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK2Q9H0K1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK2Q9H0K1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms