Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCSER1Q9C0I3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCSER1Q9C0I3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCSER1Q9C0I3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCSER1Q9C0I3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCSER1Q9C0I3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCSER1Q9C0I3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCSER1Q9C0I3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCSER1Q9C0I3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCSER1Q9C0I3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCSER1Q9C0I3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCSER1Q9C0I3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCSER1Q9C0I3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCSER1Q9C0I3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCSER1Q9C0I3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCSER1Q9C0I3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CCSER1Q9C0I3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCSER1Q9C0I3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCSER1Q9C0I3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCSER1Q9C0I3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCSER1Q9C0I3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCSER1Q9C0I3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCSER1Q9C0I3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCSER1Q9C0I3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCSER1Q9C0I3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCSER1Q9C0I3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
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