Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms