Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARD6BQ9BYG5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARD6BQ9BYG5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARD6BQ9BYG5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARD6BQ9BYG5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARD6BQ9BYG5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARD6BQ9BYG5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARD6BQ9BYG5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARD6BQ9BYG5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARD6BQ9BYG5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARD6BQ9BYG5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARD6BQ9BYG5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARD6BQ9BYG5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARD6BQ9BYG5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARD6BQ9BYG5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PARD6BQ9BYG5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARD6BQ9BYG5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARD6BQ9BYG5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARD6BQ9BYG5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARD6BQ9BYG5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARD6BQ9BYG5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARD6BQ9BYG5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARD6BQ9BYG5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARD6BQ9BYG5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARD6BQ9BYG5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARD6BQ9BYG5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARD6BQ9BYG5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARD6BQ9BYG5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PARD6BQ9BYG5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARD6BQ9BYG5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARD6BQ9BYG5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARD6BQ9BYG5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARD6BQ9BYG5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARD6BQ9BYG5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARD6BQ9BYG5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARD6BQ9BYG5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARD6BQ9BYG5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARD6BQ9BYG5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARD6BQ9BYG5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARD6BQ9BYG5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARD6BQ9BYG5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARD6BQ9BYG5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARD6BQ9BYG5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARD6BQ9BYG5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PARD6BQ9BYG5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARD6BQ9BYG5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms