Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC12A9Q9BXP2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC12A9Q9BXP2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC12A9Q9BXP2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC12A9Q9BXP2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC12A9Q9BXP2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC12A9Q9BXP2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC12A9Q9BXP2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC12A9Q9BXP2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC12A9Q9BXP2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC12A9Q9BXP2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC12A9Q9BXP2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC12A9Q9BXP2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC12A9Q9BXP2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC12A9Q9BXP2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC12A9Q9BXP2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC12A9Q9BXP2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC12A9Q9BXP2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC12A9Q9BXP2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms