Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC3Q9BQ90 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC3Q9BQ90 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC3Q9BQ90 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC3Q9BQ90 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC3Q9BQ90 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC3Q9BQ90 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC3Q9BQ90 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC3Q9BQ90 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC3Q9BQ90 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC3Q9BQ90 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC3Q9BQ90 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHDC3Q9BQ90 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC3Q9BQ90 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC3Q9BQ90 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms