Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMSS1Q9BQ75 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMSS1Q9BQ75 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMSS1Q9BQ75 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMSS1Q9BQ75 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 686.6 ms