Protein–RNA interactions for Protein: Q96PG1

MS4A4E, Putative membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4E, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4EQ96PG1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4EQ96PG1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A4EQ96PG1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A4EQ96PG1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4EQ96PG1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4EQ96PG1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4EQ96PG1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4EQ96PG1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4EQ96PG1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4EQ96PG1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4EQ96PG1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4EQ96PG1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4EQ96PG1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A4EQ96PG1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4EQ96PG1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4EQ96PG1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4EQ96PG1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4EQ96PG1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4EQ96PG1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4EQ96PG1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4EQ96PG1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4EQ96PG1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms