Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC3BQ96NL0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC3BQ96NL0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC3BQ96NL0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC3BQ96NL0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUNDC3BQ96NL0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC3BQ96NL0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC3BQ96NL0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC3BQ96NL0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC3BQ96NL0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC3BQ96NL0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RUNDC3BQ96NL0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUNDC3BQ96NL0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUNDC3BQ96NL0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUNDC3BQ96NL0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUNDC3BQ96NL0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC3BQ96NL0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC3BQ96NL0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC3BQ96NL0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUNDC3BQ96NL0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC3BQ96NL0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC3BQ96NL0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUNDC3BQ96NL0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUNDC3BQ96NL0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC3BQ96NL0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC3BQ96NL0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RUNDC3BQ96NL0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUNDC3BQ96NL0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUNDC3BQ96NL0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUNDC3BQ96NL0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUNDC3BQ96NL0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUNDC3BQ96NL0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC3BQ96NL0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNDC3BQ96NL0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC3BQ96NL0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUNDC3BQ96NL0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms