Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABS1Q96KC9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABS1Q96KC9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABS1Q96KC9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABS1Q96KC9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CABS1Q96KC9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABS1Q96KC9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABS1Q96KC9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABS1Q96KC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CABS1Q96KC9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABS1Q96KC9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABS1Q96KC9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABS1Q96KC9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABS1Q96KC9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABS1Q96KC9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABS1Q96KC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABS1Q96KC9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABS1Q96KC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABS1Q96KC9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABS1Q96KC9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABS1Q96KC9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABS1Q96KC9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABS1Q96KC9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABS1Q96KC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABS1Q96KC9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CABS1Q96KC9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CABS1Q96KC9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CABS1Q96KC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CABS1Q96KC9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CABS1Q96KC9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CABS1Q96KC9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CABS1Q96KC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CABS1Q96KC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CABS1Q96KC9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABS1Q96KC9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABS1Q96KC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABS1Q96KC9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABS1Q96KC9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABS1Q96KC9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms