Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRAMD1AQ96CP6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRAMD1AQ96CP6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRAMD1AQ96CP6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRAMD1AQ96CP6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRAMD1AQ96CP6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRAMD1AQ96CP6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRAMD1AQ96CP6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRAMD1AQ96CP6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRAMD1AQ96CP6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRAMD1AQ96CP6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRAMD1AQ96CP6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GRAMD1AQ96CP6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRAMD1AQ96CP6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRAMD1AQ96CP6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRAMD1AQ96CP6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRAMD1AQ96CP6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.1 ms