Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3KBP1Q96B97 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH3KBP1Q96B97 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3KBP1Q96B97 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3KBP1Q96B97 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3KBP1Q96B97 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3KBP1Q96B97 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3KBP1Q96B97 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3KBP1Q96B97 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3KBP1Q96B97 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3KBP1Q96B97 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3KBP1Q96B97 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3KBP1Q96B97 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3KBP1Q96B97 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3KBP1Q96B97 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3KBP1Q96B97 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms