Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
VTI1AQ96AJ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VTI1AQ96AJ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VTI1AQ96AJ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VTI1AQ96AJ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VTI1AQ96AJ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VTI1AQ96AJ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VTI1AQ96AJ9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VTI1AQ96AJ9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VTI1AQ96AJ9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VTI1AQ96AJ9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VTI1AQ96AJ9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
VTI1AQ96AJ9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
VTI1AQ96AJ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
VTI1AQ96AJ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
VTI1AQ96AJ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VTI1AQ96AJ9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VTI1AQ96AJ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
VTI1AQ96AJ9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VTI1AQ96AJ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VTI1AQ96AJ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VTI1AQ96AJ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms