Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX4Q969G2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX4Q969G2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX4Q969G2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX4Q969G2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX4Q969G2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX4Q969G2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX4Q969G2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX4Q969G2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX4Q969G2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX4Q969G2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX4Q969G2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX4Q969G2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX4Q969G2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX4Q969G2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX4Q969G2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX4Q969G2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX4Q969G2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX4Q969G2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX4Q969G2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHX4Q969G2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms