Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RAD50Q92878 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RAD50Q92878 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RAD50Q92878 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RAD50Q92878 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RAD50Q92878 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RAD50Q92878 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RAD50Q92878 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RAD50Q92878 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RAD50Q92878 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RAD50Q92878 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD50Q92878 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RAD50Q92878 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RAD50Q92878 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RAD50Q92878 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RAD50Q92878 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RAD50Q92878 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RAD50Q92878 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RAD50Q92878 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RAD50Q92878 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
RAD50Q92878 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
RAD50Q92878 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms