Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWN9

IPCEF1, Interactor protein for cytohesin exchange factors 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPCEF1Q8WWN9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IPCEF1Q8WWN9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IPCEF1Q8WWN9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IPCEF1Q8WWN9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IPCEF1Q8WWN9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IPCEF1Q8WWN9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IPCEF1Q8WWN9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IPCEF1Q8WWN9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IPCEF1Q8WWN9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IPCEF1Q8WWN9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IPCEF1Q8WWN9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IPCEF1Q8WWN9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IPCEF1Q8WWN9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IPCEF1Q8WWN9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IPCEF1Q8WWN9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IPCEF1Q8WWN9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IPCEF1Q8WWN9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IPCEF1Q8WWN9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IPCEF1Q8WWN9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IPCEF1Q8WWN9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IPCEF1Q8WWN9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IPCEF1Q8WWN9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IPCEF1Q8WWN9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms