Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF40

FNIP1, Folliculin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP1Q8TF40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FNIP1Q8TF40 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FNIP1Q8TF40 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FNIP1Q8TF40 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FNIP1Q8TF40 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FNIP1Q8TF40 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FNIP1Q8TF40 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNIP1Q8TF40 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNIP1Q8TF40 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FNIP1Q8TF40 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FNIP1Q8TF40 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FNIP1Q8TF40 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FNIP1Q8TF40 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FNIP1Q8TF40 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FNIP1Q8TF40 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms