Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX29Q8TEQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX29Q8TEQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX29Q8TEQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SNX29Q8TEQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SNX29Q8TEQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SNX29Q8TEQ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNX29Q8TEQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNX29Q8TEQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNX29Q8TEQ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNX29Q8TEQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX29Q8TEQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNX29Q8TEQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SNX29Q8TEQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX29Q8TEQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX29Q8TEQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX29Q8TEQ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX29Q8TEQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX29Q8TEQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNX29Q8TEQ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNX29Q8TEQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNX29Q8TEQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms